Studera resistensutveckling genom att utnyttja vätskebiopsier

Forskningsprojekt, 2025 – 2028

Resistens är ett stort problem inom medicin idag. Det är därför vi inte kan erbjuda ett bestående botemedel för många cancerformer: även om vi använder den mest avancerade behandlingen kan det finnas celler i cancern som ignorerar behandlingen och fortsätter att växa. Så det är viktigt att förstå alla detaljer om hur resistens uppstår. Det finns fortfarande många obesvarade frågor om resistens, till exempel hur snabbt utvecklas det? vad gör resistenta celler resistenta? hur lika/olika är två patienter med samma typ av cancer och behandling?

I detta projekt vill vi svara på dessa frågor med hjälp av så kallade vätskebiopsier, bitar av cancerns DNA som finns i vanliga blodprover från en patient. Vanligtvis vet vi bara hur en cancer ser ut när den upptäcks. Vätskebiopsier hjälper oss att följa den över tid under behandlingen, utan extra obehag för patienten. Men flytande biopsier skiljer sig från vanliga cancerprover, so vi kan inte använda våra vanliga datorprogram för att analysera dem. Därför kombinerar vi i detta projekt kunskap från bioinformatik, maskininlärning och matematik för att göra nya programvaror och skapa en personlig datorbaserad simulering av en patients cancer från data från vätskebiopsier. Vi tillämpar denna metod på blodprover som samlats in från en varierad grupp cancerpatienter i Storbritannien och Sverige. Med vår datorbaserade version av varje cancer kommer vi att kunna svara på hur och varför resistens utvecklades för just den personen. Denna kunskap kommer att hjälpa läkare att göra bättre behandlingsplaner och forskare att komma med effektivare botemedel mot resistens.