Bakteriella tyrosinkinashämmare: en väg till nya antibiotika?

Forskningsprojekt, 2026 – 2030

Misslyckande med antibiotikabehandlingar är ett växande problem, främst drivet av ökningen av antimikrobiell resistens (AMR). Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus och Streptococcus pneumoniae är bland de vanligaste antimikrobiella resistenta bakterier som rapporterats i världshälsoorganisationens (WHO) AMR-övervakningsrapporter över hela världen. Upptäckten av nya antibiotika släpar efter behovet av behandling av AMR-infektioner. Vår grupp har nyligen gjort ett upptäckt som kan leda till en ny klass av antibiotika. En viktig aspekt av bakterier är deras förmåga att bygga en skyddande kapsel, som är gjord av extracellulära polysackarider (EPS). Syntes av EPS styrs av en speciell klass av proteiner som kallas bakteriella proteintyrosinkinaser (BY-kinaser). Vi har nyligen upptäckt ett protein som används av bakterier för att tillfälligt hämma BY-kinaser i syfte att överleva oxidativ stress. Vi vill använda denna kunskap för att göra starkare och mer permanenta hämmare av BY-kinaser. Detta kommer att göras med hjälp av artificiell intelligens (AI), som vi kommer att använda för att designa och göra effektiva BY-kinashämmare. Eftersom BY-kinaser behövs för många cellulära reaktioner (t.ex. DNA-delning), förväntas deras totala hämning skada bakterier och hämma deras potential att orsaka infektioner. Vi hoppas vi att detta nya tillvägagångssätt kommer att resultera i framtida antibiotika. Eftersom BY-kinaser finns i de flesta bakterier, men inte i människor, är de bra mål för utveckling av nya läkemedel. Effektiva BY-kinashämmare skulle vara mycket skadliga för bakterier, men säkra för människor. För att uppnå detta viktiga mål kommer vi att använda en tvärvetenskaplig kombination av experimentella och beräkningsmetoder. Dessa inkluderar biokemiska och molekylärbiologiska analyser, struktur/funktionsstudier, kvantitativ fosfoproteomik, avancerad mikroskopi, funktionalisering av nanomaterial, infektion av mänskliga celler, och användning av generativ AI.