The human secretome
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2019

The proteins secreted by human cells (collectively referred to as the secretome) are important not only for the basic understanding of human biology but also for the identification of potential targets for future diagnostics and therapies. Here, we present a comprehensive analysis of proteins predicted to be secreted in human cells, which provides information about their final localization in the human body, including the proteins actively secreted to peripheral blood. The analysis suggests that a large number of the proteins of the secretome are not secreted out of the cell, but instead are retained intracellularly, whereas another large group of proteins were identified that are predicted to be retained locally at the tissue of expression and not secreted into the blood. Proteins detected in the human blood by mass spectrometry-based proteomics and antibody-based immuno-assays are also presented with estimates of their concentrations in the blood. The results are presented in an updated version 19 of the Human Protein Atlas in which each gene encoding a secretome protein is annotated to provide an open-access knowledge resource of the human secretome, including body-wide expression data, spatial localization data down to the single-cell and subcellular levels, and data about the presence of proteins that are detectable in the blood.

Författare

Mathias Uhlen

Karolinska Institutet

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Max J. Karlsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Andreas Hober

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Anne-Sophie Svensson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Julia Scheffel

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

David Kotol

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Wen Zhong

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Abdellah Tebani

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Linnea Strandberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Fredrik Edfors

Stanford Univ, Dept Genet, Sch Med

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Evelina Sjostedt

Karolinska Institutet

Jan Mulder

Karolinska Institutet

Adil Mardinoglu

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Anna Berling

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Siri Ekblad

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Melanie Dannemeyer

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Sara Kanje

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Johan Rockberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Magnus Lundqvist

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Magdalena Malm

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Anna-Luisa Volk

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Peter Nilsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Anna Manberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Tea Dodig-Crnkovic

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Elisa Pin

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Martin Zwahlen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Per Oksvold

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Kalle von Feilitzen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Ragna S. Haussler

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Mun-Gwan Hong

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Cecilia Lindskog

Uppsala universitet

Fredrik Ponten

Uppsala universitet

Borbala Katona

Uppsala universitet

Jimmy Vuu

Uppsala universitet

Emil Lindstrom

Uppsala universitet

Jens B Nielsen

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Jonathan Robinson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Burcu Ayoglu

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Diana Mahdessian

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Devin Sullivan

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Peter Thul

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Frida Danielsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Charlotte Stadler

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Emma Lundberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Goran Bergstrom

Göteborgs universitet

Anders Gummesson

Göteborgs universitet

Bjorn G. Voldborg

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Hanna Tegel

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Sophia Hober

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Bjorn Forsstrom

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Jochen M. Schwenk

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Linn Fagerberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Asa Sivertsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Science signaling

1937-9145 (ISSN)

Vol. 12 609 eaaz0274

Ämneskategorier

Cell- och molekylärbiologi

Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)

Bioinformatik och systembiologi

DOI

10.1126/scisignal.aaz0274

PubMed

31772123

Mer information

Senast uppdaterat

2020-01-08