The human secretome
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2019
The proteins secreted by human cells (collectively referred to as the secretome) are important not only for the basic understanding of human biology but also for the identification of potential targets for future diagnostics and therapies. Here, we present a comprehensive analysis of proteins predicted to be secreted in human cells, which provides information about their final localization in the human body, including the proteins actively secreted to peripheral blood. The analysis suggests that a large number of the proteins of the secretome are not secreted out of the cell, but instead are retained intracellularly, whereas another large group of proteins were identified that are predicted to be retained locally at the tissue of expression and not secreted into the blood. Proteins detected in the human blood by mass spectrometry-based proteomics and antibody-based immuno-assays are also presented with estimates of their concentrations in the blood. The results are presented in an updated version 19 of the Human Protein Atlas in which each gene encoding a secretome protein is annotated to provide an open-access knowledge resource of the human secretome, including body-wide expression data, spatial localization data down to the single-cell and subcellular levels, and data about the presence of proteins that are detectable in the blood.
Författare
Mathias Uhlen
Karolinska Institutet
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
Max J. Karlsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Andreas Hober
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Anne-Sophie Svensson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Julia Scheffel
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
David Kotol
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Wen Zhong
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Abdellah Tebani
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Linnea Strandberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Fredrik Edfors
Stanford University
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Evelina Sjostedt
Karolinska Institutet
Jan Mulder
Karolinska Institutet
Adil Mardinoglu
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Anna Berling
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Siri Ekblad
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Melanie Dannemeyer
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Sara Kanje
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Johan Rockberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Magnus Lundqvist
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Magdalena Malm
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Anna-Luisa Volk
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Peter Nilsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Anna Manberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Tea Dodig-Crnkovic
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Elisa Pin
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Martin Zwahlen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Per Oksvold
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Kalle von Feilitzen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Ragna S. Haussler
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Mun-Gwan Hong
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Cecilia Lindskog
Uppsala universitet
Fredrik Ponten
Uppsala universitet
Borbala Katona
Uppsala universitet
Jimmy Vuu
Uppsala universitet
Emil Lindstrom
Uppsala universitet
Jens B Nielsen
Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi
Jonathan Robinson
Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi
Burcu Ayoglu
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Diana Mahdessian
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Devin Sullivan
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Peter Thul
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Frida Danielsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Charlotte Stadler
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Emma Lundberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Goran Bergstrom
Göteborgs universitet
Anders Gummesson
Göteborgs universitet
Bjorn G. Voldborg
Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
Hanna Tegel
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Sophia Hober
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Bjorn Forsstrom
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Jochen M. Schwenk
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Linn Fagerberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Asa Sivertsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Science signaling
19450877 (ISSN) 19379145 (eISSN)
Vol. 12 609 eaaz0274Ämneskategorier
Cell- och molekylärbiologi
Medicinsk bioteknologi (med inriktning mot cellbiologi (inklusive stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)
Bioinformatik och systembiologi
DOI
10.1126/scisignal.aaz0274
PubMed
31772123