Tissue-based map of the human proteome
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2015

Resolving the molecular details of proteome variation in the different tissues and organs of the human body will greatly increase our knowledge of human biology and disease. Here, we present a map of the human tissue proteome based on an integrated omics approach that involves quantitative transcriptomics at the tissue and organ level, combined with tissue microarray-based immunohistochemistry, to achieve spatial localization of proteins down to the single-cell level. Our tissue-based analysis detected more than 90% of the putative protein-coding genes.We used this approach to explore the human secretome, the membrane proteome, the druggable proteome, the cancer proteome, and the metabolic functions in 32 different tissues and organs. All the data are integrated in an interactive Web-based database that allows exploration of individual proteins, as well as navigation of global expression patterns, in all major tissues and organs in the human body.

Författare

M. Uhlen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

L. Fagerberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

B.M. Hallström

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

C. Lindskog

Uppsala universitet

P. Oksvold

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Adil Mardinoglu

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Å. Sivertsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

C. Kampf

Uppsala universitet

E. Sjostedt

Uppsala universitet

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

A. Asplund

Uppsala universitet

I. Olsson

Uppsala universitet

K. Edlund

Leibniz Research Centre for Working Environment and Human Factors at the University of Dortmund

E. Lundberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

S. Navani

Lab Surgpath

C.A.K. Szigyarto

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

J. Odeberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

D. Djureinovic

Uppsala universitet

J.O. Takanen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

S. Hober

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

T. Alm

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

P. H. Edqvist

Uppsala universitet

H. Berling

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

H. Tegel

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

J. Mulder

Karolinska Institutet

J. Rockberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

P. Nilsson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

J. M. Schwenk

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

M. Hamsten

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

K. von Feilitzen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

M. Forsberg

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

L. Persson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

F. Johansson

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

M. Zwahlen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

G. von Heijne

Stockholms universitet

Jens B Nielsen

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

F. Ponten

Uppsala universitet

Science

0036-8075 (ISSN)

Vol. 347 394-

Ämneskategorier

Biologiska vetenskaper

Infrastruktur

C3SE (Chalmers Centre for Computational Science and Engineering)

Styrkeområden

Livsvetenskaper och teknik

DOI

10.1126/science.1260419