Tissue-based map of the human proteome
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2015
Resolving the molecular details of proteome variation in the different tissues and organs of the human body will greatly increase our knowledge of human biology and disease. Here, we present a map of the human tissue proteome based on an integrated omics approach that involves quantitative transcriptomics at the tissue and organ level, combined with tissue microarray-based immunohistochemistry, to achieve spatial localization of proteins down to the single-cell level. Our tissue-based analysis detected more than 90% of the putative protein-coding genes.We used this approach to explore the human secretome, the membrane proteome, the druggable proteome, the cancer proteome, and the metabolic functions in 32 different tissues and organs. All the data are integrated in an interactive Web-based database that allows exploration of individual proteins, as well as navigation of global expression patterns, in all major tissues and organs in the human body.
Författare
M. Uhlen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
L. Fagerberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
B.M. Hallström
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
C. Lindskog
Uppsala universitet
P. Oksvold
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
Adil Mardinoglu
Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi
Å. Sivertsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
C. Kampf
Uppsala universitet
E. Sjostedt
Uppsala universitet
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
A. Asplund
Uppsala universitet
I. Olsson
Uppsala universitet
K. Edlund
Leibniz Research Centre for Working Environment and Human Factors at the University of Dortmund
E. Lundberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
S. Navani
Lab Surgpath
C.A.K. Szigyarto
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
J. Odeberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
D. Djureinovic
Uppsala universitet
J.O. Takanen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
S. Hober
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
T. Alm
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
P. H. Edqvist
Uppsala universitet
H. Berling
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
H. Tegel
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
J. Mulder
Karolinska Institutet
J. Rockberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
P. Nilsson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
J. M. Schwenk
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
M. Hamsten
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
K. von Feilitzen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
M. Forsberg
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
L. Persson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
F. Johansson
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
M. Zwahlen
Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)
G. von Heijne
Stockholms universitet
Jens B Nielsen
Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi
F. Ponten
Uppsala universitet
Science
0036-8075 (ISSN) 1095-9203 (eISSN)
Vol. 347 6220 394- 1260419Ämneskategorier
Biologiska vetenskaper
Infrastruktur
C3SE (Chalmers Centre for Computational Science and Engineering)
Styrkeområden
Livsvetenskaper och teknik (2010-2018)
DOI
10.1126/science.1260419