Statistical modelling and analyses of DNA sequence data with applications to metagenomics
Doktorsavhandling, 2017
bioinformatics
normalisation
gene abundance data
generalised hidden Markov models
statistical modelling
DNA sequence data
metagenomics
Författare
Mariana Buongermino Pereira
Chalmers, Matematiska vetenskaper, Tillämpad matematik och statistik
Inkluderade delarbeten
HattCI: Fast and Accurate attC site Identification Using Hidden Markov Models.
Journal of Computational Biology,;Vol. 23(2016)p. 891-902
Artikel i vetenskaplig tidskrift
A comprehensive survey of integron-mediated genes present in metagenomes.
Manuskript
Computational and statistical considerations in the analysis of metagenomic data. (Accepted)
Manuskript
Comparison of normalization methods for the analysis of metagenomic gene abundance data.
Manuskript
Kategorisering
Ämneskategorier (SSIF 2011)
Bioinformatik (beräkningsbiologi)
Sannolikhetsteori och statistik
Identifikatorer
ISBN
978-91-7597-607-5
Övrigt
Serie
Doktorsavhandlingar vid Chalmers tekniska högskola. Ny serie: 4288
Utgivare
Chalmers
Examination
2017-09-22 12:15
Pascal, Department of Mathematical Sciences, Chalmers tvärgata 3, Gothenburg
Opponent: Inge Jonassen