An atlas of human metabolism
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2020

Genome-scale metabolic models (GEMs) are valuable tools to study metabolism and provide a scaffold for the integrative analysis of omics data. Researchers have developed increasingly comprehensive human GEMs, but the disconnect among different model sources and versions impedes further progress. We therefore integrated and extensively curated the most recent human metabolic models to construct a consensus GEM, Human1. We demonstrated the versatility of Human1 through the generation and analysis of cell- and tissue-specific models using transcriptomic, proteomic, and kinetic data. We also present an accompanying web portal, Metabolic Atlas (https://www.metabolicatlas.org/), which facilitates further exploration and visualization of Human1 content. Human1 was created using a version-controlled, open-source model development framework to enable community-driven curation and refinement. This framework allows Human1 to be an evolving shared resource for future studies of human health and disease.

Författare

Jonathan Robinson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Pinar Kocabas

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Hao Wang

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Göteborgs universitet

Forskning Andra publikationer

Pierre-Etienne Cholley

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Daniel John Cook

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Avlant Nilsson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Petre Mihail Anton

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Raphael Ferreira

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Iván Domenzain Del Castillo Cerecer

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Virinchi Billa

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi, Data management

Forskning Andra publikationer

Angelo Limeta

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Alex Hedin

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Johan Gustafsson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Eduard Kerkhoven

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Thomas Svensson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Bernhard O. Palsson

University of California

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Adil Mardinoglu

King's College London

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Lena Hansson

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Mathias Uhlen

Kungliga Tekniska Högskolan (KTH)

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Jens B Nielsen

BioInnovation Institute

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Chalmers, Biologi och bioteknik, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Science signaling

1937-9145 (ISSN)

Vol. 13 624 eaaz1482

Ämneskategorier

Annan data- och informationsvetenskap

Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Bioinformatik och systembiologi

DOI

10.1126/scisignal.aaz1482

Publikationsdata kopplat till DOI

PubMed

32209698

Mer information

Senast uppdaterat

2020-05-25

Feedback och support

Om du har frågor, behöver hjälp, hittar en bugg eller vill ge feedback kan du göra det här nedan. Du når oss också direkt per e-post research.lib@chalmers.se eller via telefon 031-772 3744.

Om tjänsten

Research.chalmers.se innehåller information om forskning på Chalmers, publikationer och projekt inklusive information om finansiärer och samarbetspartners.

Läs mer om tjänsten, täckningsgrad och vilka som kan se informationen

Personuppgifter och cookies

Citation Style Language
citeproc-js (Frank Bennett)

Länkar

Chalmers bibliotek
Chalmers forskning
Forskningsprojekt på chalmers.se

Chalmers tekniska högskola

412 96 GÖTEBORG
TELEFON: 031-772 10 00
WWW.CHALMERS.SE