Hierarkiska mixed effects-modeller av dynamiska system
Forskningsprojekt , 2014 – 2019

Syfte Biologiska system är heterogena och hierarkiska till sin natur. Att studera populationsmedelvärden ger ingen information om beteenden hos individuella personer eller celler. Omvänt kan stora spridningar i mellan individer göra att det är svårt att mäta gruppegenskaper. Vi planerar att utveckla modeller som inte bara fångar denna heterogenitet men som också utnyttjar variation för att bestämma modellparameterar. Arbetsplan Vi kommer använda tre tillämpningar inom biologi och medicin som exempel; dynamiken i rörelse och celldelning hos celler från hjärntumörer; lipidmetabolism i människa; Reglering av glukosmetabolism i jästceller. Arbetet delas in i tre projekt som alla berör de tre tillämpningarna: non-linear mixed effect (NLME) modelling av dynamiska system, övergång från ordinära till partiella differentialekvationer (homogenisering), och olika sätt att hantera osäkerheter i modeller och data genom stokastiska differentialekvationer. Det fjärde projektet innefattar implementering av dessa metoder i en mjukvara som skall användas för att lösa problem i de tre applikationerna. Förväntade resultat Valet av de tre olika tillämpningarna garanterar en bredd i projektet som gör att metoderna måste vara generella och tillämpningsbara i många situationer. Av stor betydelse är att de tre tillämpningarna, i vilka sökandena redan är ledande, garanterar att resultaten snabbt kan tillämpas och användas för att demonstrera styrkan och fördelarna med de utvecklade metoderna.

Deltagare

Bernt Wennberg (kontakt)

Prefekt vid Chalmers, Matematiska vetenskaper

Martin Adiels

Forskarassistent vid Matematik

Philip Gerlee

Docent vid Chalmers, Matematiska vetenskaper, Tillämpad matematik och statistik

Torbjörn Lundh

Biträdande professor vid Chalmers, Matematiska vetenskaper, Tillämpad matematik och statistik

Samarbetspartners

Sahlgrenska universitetssjukhuset

Gothenburg, Sweden

Stiftelsen Fraunhofer-Chalmers Centrum för Industrimatematik

Göteborg, Sweden

Finansiering

Stiftelsen för Strategisk forskning (SSF)

Finansierar Chalmers deltagande under 2014–2019 med 20 000 000,00 SEK

Relaterade styrkeområden och infrastruktur

Livsvetenskaper och teknik

Styrkeområden

Mer information

Senast uppdaterat

2015-06-02