Prospects for systems biology and modeling of the gut microbiome
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2011

Abundant microorganisms that inhabit the human intestine are implicated in health and disease. The gut microbiome has been studied with metagenomic tools, and over 3 million genes have been discovered, constituting a 'parts list' of this ecosystem; further understanding requires studies of the interacting parts. Mouse models have provided a glimpse into the microbiota and host interactions at metabolic and immunologic levels; however, to provide more insight, there is a need to generate mathematical models that can reveal genotype-phenotype relationships and provide scaffolds for integrated analyses. To this end, we propose the use of genome-scale metabolic models that have successfully been used in studying interactions between human hosts and microbes, as well as microbes in isolation and in communities.

metabolic

butyrate

bacterial mutualism

receptor

diet-induced obesity

chain fatty-acids

human colonic microbiota

protein-coupled

reconstruction

networks

high-throughput

inflammatory bowel diseases

Författare

Fredrik Karlsson

Chalmers, Kemi- och bioteknik, Livsvetenskaper, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Intawat Nookaew

Chalmers, Kemi- och bioteknik, Livsvetenskaper, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Dina Petranovic Nielsen

Chalmers, Kemi- och bioteknik, Livsvetenskaper, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Jens B Nielsen

Chalmers, Kemi- och bioteknik, Livsvetenskaper, Systembiologi

Forskning Andra publikationer

Trends in Biotechnology

0167-7799 (ISSN)

Vol. 29 6 251-258

Ämneskategorier

Industriell bioteknik

Styrkeområden

Livsvetenskaper och teknik (2010-2018)

DOI

10.1016/j.tibtech.2011.01.009

Publikationsdata kopplat till DOI

Mer information

Skapat

2017-10-07

Feedback och support

Om du har frågor, behöver hjälp, hittar en bugg eller vill ge feedback kan du göra det här nedan. Du når oss också direkt per e-post research.lib@chalmers.se eller via telefon 031-772 3744.

Om tjänsten

Research.chalmers.se innehåller information om forskning på Chalmers, publikationer och projekt inklusive information om finansiärer och samarbetspartners.

Läs mer om tjänsten, täckningsgrad och vilka som kan se informationen

Personuppgifter och cookies

Länkar

Chalmers bibliotek
Chalmers forskning
Forskningsprojekt på chalmers.se

Chalmers tekniska högskola

412 96 GÖTEBORG
TELEFON: 031-772 10 00
WWW.CHALMERS.SE