Genome sequence of Rhizomucor pusillus FCH 5.7, a thermophilic zygomycete involved in plant biomass degradation harbouring putative GH9 endoglucanases
Artikel i vetenskaplig tidskrift, 2018
We report here the annotated draft genome sequence of the thermophilic zygomycete Rhizomucor pusillus strain FCH 5.7, isolated from compost soil in Vietnam. The genome assembly contains 25.59 Mb with an overall GC content of 44.95%, and comprises 10,898 protein coding genes. Genes encoding putative cellulose-, xylan- and chitin-degrading proteins were identified, including two putative endoglucanases (EC 3.2.1.4) from glycoside hydrolase family 9, which have so far been mostly assigned to bacteria and plants.
CAZyme
Carbohydrate-active enzymes
GH9
Endoglucanase
R. miehei
Thermophilic
Författare
Silvia Hüttner
Wallenberg Wood Science Center (WWSC)
Chalmers, Biologi och bioteknik, Industriell bioteknik
Z. Granchi
GenomeScan B.V.
T. T. Nguyen
Food Industries Research Institute
Sake van Pelt
GenomeScan B.V.
Johan Larsbrink
Chalmers, Biologi och bioteknik, Industriell bioteknik
Wallenberg Wood Science Center (WWSC)
V. N. Thanh
Food Industries Research Institute
Lisbeth Olsson
Wallenberg Wood Science Center (WWSC)
Chalmers, Biologi och bioteknik, Industriell bioteknik
Biotechnology Reports
2215-017X (eISSN)
Vol. 20 e00279Enzymer upptäckt och produktion i Vietnam för produktion av hållbara biobränslen och biokemikalier
Vetenskapsrådet (VR) (2014-3523), 2014-12-01 -- 2016-12-31.
Drivkrafter
Hållbar utveckling
Styrkeområden
Energi
Livsvetenskaper och teknik (2010-2018)
Fundament
Grundläggande vetenskaper
Ämneskategorier (SSIF 2011)
Mikrobiologi
Växtbioteknologi
Genetik
DOI
10.1016/j.btre.2018.e00279