Karolin Frykholm

Forskare vid Kemisk biologi

Jag är forskare i professor Fredrik Westerlunds forskargrupp, där vi använder nanokanaler och fluorescensmikroskopi för att studera enstaka DNA-molekyler. Med hjälp av metoder som utvecklats i gruppen kan vi kartlägga långa sekvenser av DNA och använda denna information för att identifiera bakterier eller plasmider. Vi kan också detektera specifika gener som plasmiderna bär på, t.ex. gener som kodar för antibiotikaresistens.

Källa: chalmers.se
Image of Karolin Frykholm

Visar 27 publikationer

2023

Strain-level bacterial typing directly from patient samples using optical DNA mapping

My Nyblom, Anna Johnning, Karolin Frykholm et al
Communications Medicine. Vol. 3 (31)
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2022

DNA in Nanochannels - Theory and Applications

Karolin Frykholm, Vilhelm Müller, Sriram Kesarimangalam et al
Quarterly Reviews of Biophysics. Vol. 55
Reviewartikel
2021

Detection of structural variations in densely-labelled optical DNA barcodes: A hidden Markov model approach

Albertas Dvirnas, Callum L. Stewart, Vilhelm Müller et al
PLoS ONE. Vol. 16 (11 November)
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2021

Polyphasic characterization of carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae clinical isolates suggests vertical transmission of the bla<inf>KPC-3</inf>gene

Catarina Ferreira, Santosh Kumar Bikarolla, Karolin Frykholm et al
PLoS ONE. Vol. 16 (2 Febuary)
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2019

Genetic variation in the conjugative plasmidome of a hospital effluent multidrug resistant Escherichia coli strain

Catarina Ferreira, D. Bogas, Santosh K. Bikarolla et al
Chemosphere. Vol. 220, p. 748-759
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2018

Hairpins in the conformations of a confined polymer

E. Werner, A. Jain, A. Muralidhar et al
Biomicrofluidics. Vol. 12 (2)
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2017

Exploring DNA-protein interactions on the single DNA molecule level using nanofluidic tools

Karolin Frykholm, Lena Nyberg, Fredrik Westerlund
Integrative Biology (United Kingdom). Vol. 9 (8), p. 650-661
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2016

DNA compaction by the bacteriophage protein Cox studied on the single DNA molecule level using nanofluidic channels

Karolin Frykholm, Ronnie Berntsson, M. Claesson et al
Nucleic Acids Research. Vol. 44 (15), p. 7219-7227
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2016

Visualizing the Nonhomogeneous Structure of RAD51 Filaments Using Nanofluidic Channels

Louise Fornander, Karolin Frykholm, Joachim Fritzsche et al
Langmuir. Vol. 32 (33), p. 8403-8412
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2016

Direct identification of antibiotic resistance genes on single plasmid molecules using CRISPR/Cas9 in combination with optical DNA mapping.

Vilhelm Müller, Fredrika Rajer, Karolin Frykholm et al
Scientific Reports. Vol. 6, p. 37938-
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2015

Using nanofluidic channels to probe dynamics of RAD51-Filaments

Louise Fornander, Mohammadreza Alizadehheidari, E. Werner et al
18th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2014, p. 1826-1828
Paper i proceeding
2015

Fast size-determination of intact bacterial plasmids using nanofluidic channels

Karolin Frykholm, Lena Nyberg, E. Lagerstedt et al
Lab on a Chip - Miniaturisation for Chemistry and Biology. Vol. 15 (13), p. 2739-2743
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2014

Probing Physical Properties of a DNA- Protein Complex Using Nanofluidic Channels

Karolin Frykholm, Mohammadreza Alizadehheidari, Joachim Fritzsche et al
Small. Vol. 10 (5), p. 884-887
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2014

Using Nanofluidic Channels to Probe the Dynamics of Rad51-DNA Filaments

Louise Fornander, F. Persson, Joachim Fritzsche et al
Biophysical Journal. Vol. 106 (2), p. 692A-693A
Artikel i övrig tidskrift
2014

Sensing Conformational Changes in DNA upon Ligand Binding Using QCM-D. Polyamine Condensation and Rad51 Extension of DNA Layers

Lu Sun, Karolin Frykholm, Louise Fornander et al
Journal of Physical Chemistry B. Vol. 118 (41), p. 11895-11904
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2013

Probing the Physical Properties of a DNA-Protein Complex Using Nanofluidic Channels

Mohammadreza Alizadehheidari, Karolin Frykholm, Joachim Fritzsche et al
European Biophysics Journal. Vol. 42, p. S134-S134
Artikel i övrig tidskrift
2013

Probing concentration-dependent behavior of DNA-binding proteins on a single-molecule level illustrated by Rad51

Karolin Frykholm, Camilla Freitag, Fredrik Persson et al
Analytical Biochemistry. Vol. 443 (2), p. 261-268
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2013

Probing physical properties of DNA-protein complexes using nanofluidic channels

Karolin Frykholm, Mohammadreza Alizadehheidari, Louise Fornander et al
17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2013; Freiburg; Germany; 27 October 2013 through 31 October 2013. Vol. 2, p. 1311-1313
Paper i proceeding
2012

Ca2+ improves organization of single-stranded DNA bases in human Rad51 filament, explaining stimulatory effect on gene recombination

Louise Fornander, Karolin Frykholm, Anna Reymer et al
Nucleic Acids Research. Vol. 40 (11), p. 4904-4913
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2010

DNA strand exchange catalyzed by molecular crowding in PEG solutions

Bobo Feng, Karolin Frykholm, Bengt Nordén et al
Chemical Communications. Vol. 46 (43), p. 8231-8233
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2009

Mechanism of DNA Strand Exchange at Liposome Surfaces Investigated Using Mismatched DNA

Karolin Frykholm, Bengt Nordén, Fredrik Westerlund
Langmuir. Vol. 25 (3), p. 1606-1611
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2009

Structure of human Rad51 protein filament from molecular modeling and site-specific linear dichroism spectroscopy

Anna Reymer, Karolin Frykholm, K. Morimatsu et al
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Vol. 106 (32), p. 13248-13253
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2008

Enhanced DNA strand exchange on positively charged liposomes

Karolin Frykholm, Francesca Baldelli Bombelli, Bengt Nordén et al
Soft Matter (4), p. 2500 - 2506
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2006

Adenovirus type 5 fiber knob domain has a critical role in fiber protein synthesis and encapsidation

Petra Henning, Emma Lundgren, Mattias Carlsson et al
Journal of General Virology. Vol. 87, p. 3151-3160
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2006

Conserved conformation of RecA protein after executing the DNA strand-exchange reaction. A site-specific linear dichroism structure study

Karolin Frykholm, K. Morimatsu, Bengt Nordén
Biochemistry. Vol. 45 (37), p. 11172-11178
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Ladda ner publikationslistor

Du kan ladda ner denna lista till din dator.

Filtrera och ladda ner publikationslista

Som inloggad användare hittar du ytterligare funktioner i MyResearch.

Du kan även exportera direkt till Zotero eller Mendeley genom webbläsarplugins. Dessa hittar du här:

Zotero Connector
Mendeley Web Importer

Tjänsten SwePub erbjuder uttag av Researchs listor i andra format, till exempel kan du få uttag av publikationer enligt Harvard och Oxford i .RIS, BibTex och RefWorks-format.

Det finns inga projekt att visa.
Det kan finnas fler projekt där Karolin Frykholm medverkar, men du måste vara inloggad som anställd på Chalmers för att kunna se dem.