Marina Axelson-Fisk

Docent vid Chalmers, Matematiska vetenskaper, Tillämpad matematik och statistik

Marina Axelson-Fisk är docent i Matematisk statistik. Hon arbetar huvudsakligen inom bioinformatik, med särskilt fokus mot stokastiska modeller och algoritmer för jämförande genomik och genletning. Hon har bland annat varit involverad i den initiala jämförande analysen av människa, mus och råtta inom the Mouse och Rat Sequencing Consortia. Hon är medlem i Linnécentrum för marin evolutionsbiologi (CeMEB), där hon är inblandad i den bioinformatiska analysen av de nya sekvenserna hos ett antal svenska marinbiologiska västkust-organismer.För mer information, se min hemsida på http://www.math.chalmers.se/~marinaa/

Källa: chalmers.se

Visar 18 publikationer

2016

HattCI: Fast and Accurate attC site Identification Using Hidden Markov Models.

Mariana Buongermino Pereira, Mikael Wallroth, Erik Kristiansson et al
Journal of Computational Biology. Vol. 23 (11), p. 891-902
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2009

Biased random walk in a one-dimensional percolation model

Marina Axelson-Fisk, Olle Häggström
Stochastic Processes and their Applications. Vol. 119 (10), p. 3395-3415
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2009

Conditional percolation on one-dimensional lattices

Marina Axelson-Fisk, Olle Häggström
Advances in Applied Probability. Vol. 41 (4), p. 3395-3415
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2005

The Cell Cycle

Marina Alexandersson
Branching Processes: Variation, Growth and Extinction of Populations, p. 218-225
Kapitel i bok
2005

Gene finding in fungal genomes

Marina Axelson-Fisk, Per Sunnerhagen
Topics in Current Genetics: Comparative genomics using fungi as models, p. 1-28
Kapitel i bok
2005

Pair hidden Markov models

Marina Alexandersson, Nicholas Bray, Lior Pachter
Encyklopedia of Genetics, Genomics, Proteomics and Bioinformatics
Kapitel i bok
2004

Bioinformatic identification of polymerizing and transmembrane mucins in the puffer fish Fugu rubripes

Tiange Lang, Marina Alexandersson, Gunnar C. Hansson et al
Glycobiology. Vol. 14 (6), p. 521-527
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2004

Accurate Identification of Novel Human Genes Through Simultaneous Gene Prediction in Human, Mouse and Rat

C. Dewey, J.Q. Wu, S. Cawley et al
Genome Research. Vol. 14 (4), p. 661-664
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2004

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

Marina Alexandersson, Rat Genome Sequencing Project Consortium
Nature. Vol. 428 (6982), p. 493-521
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2003

Picking Alignments from (Steiner) Trees

Fumei Lam, Marina Alexandersson, Lior Pachter
Journal of Computational Biology. Vol. 10 (3-4), p. 509-520
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2003

SLAM webserver for comparative gene finding and alignment

Simon Cawley, Lior Pachter, Marina Alexandersson
Nucleic Acids Research. Vol. 31 (13), p. 3507-3509
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2003

SLAM: Cross-species Gene Finding and Alignment with a Generalized Pair Hidden Markov Model

Marina Alexandersson, Simon Cawley, Lior Pachter
Genome Research. Vol. 13 (3), p. 496-502
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2002

Applications of Generalized Pair Hidden Markov Models to Alignment and Gene Finding Problems

Lior Pachter, Marina Alexandersson, Simon Cawley
Journal of Computational Biology. Vol. 9 (2), p. 389-399
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2002

Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome

Marina Alexandersson, Mouse Genome Sequencing Consortium
Nature. Vol. 420 (6915), p. 520-562
Artikel i vetenskaplig tidskrift
2001

Existence of the Stable Birth Type Distribution in a General Branching Process Cell Cycle Model with Unequal Cell Division

Marina Alexandersson
Journal of Applied Probability. Vol. 38 (3), p. 673-685
Artikel i vetenskaplig tidskrift
1998

Branching processes and cell populations

Marina Alexandersson
Licentiatavhandling
1998

An Application of General Branching Processes to a Cell Cycle Model with Two Uncoupled Subcycles and Unequal Cell Division

Marina Alexandersson
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science. Vol. 1, p. 131-145
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Spara referenser

Om du har installerat Zotero eller Mendeley på din dator kan du direkt ta ut referenser från de publikationer du ser i listan.

Du laddar ner dessa pluginer här:
Zotero
Mendeley

Visar 2 forskningsprojekt

2012–2015

Statistisk signifikans hos biologiska sekvenser

Marina Axelson-Fisk Tillämpad matematik och statistik
Vetenskapsrådet (VR)

2011–2013

Nästa Generationens Komparativa Genomik

Marina Axelson-Fisk Tillämpad matematik och statistik
Vetenskapsrådet (VR)

Det kan finnas fler projekt där Marina Axelson-Fisk medverkar, men du måste vara inloggad som anställd på Chalmers för att kunna se dem.